More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_R0010 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  97.37 
 
 
79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  97.37 
 
 
79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  97.37 
 
 
79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  97.37 
 
 
79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  97.37 
 
 
79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  97.37 
 
 
79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  97.26 
 
 
78 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  97.26 
 
 
78 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  97.26 
 
 
76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  97.26 
 
 
76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  97.26 
 
 
76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  97.26 
 
 
78 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  97.26 
 
 
73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  97.1 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  97.1 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  97.1 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  97.1 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  100 
 
 
78 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  95.65 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000810946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  95.65 
 
 
76 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0086  tRNA-Thr  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0036  tRNA-Thr  96.83 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.290713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0065  tRNA-Thr  96.83 
 
 
73 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00709117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0076  tRNA-Thr  96.83 
 
 
73 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0079  tRNA-Thr  96.83 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0289577  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  98.11 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  93.55 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478027  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  91.3 
 
 
155 bp  89.7  9e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0110  tRNA-Thr  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0045  tRNA-Thr  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0029  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379837  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0103  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000466787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0029  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132706  normal  0.393089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0022  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00933326  normal  0.943049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0069  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.489026  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4244  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0013  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0044  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550992  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0048  tRNA-Thr  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000535442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4289  tRNA-Thr  95.74 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.11347e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0005  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000832804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0004  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000250718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0103  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000642659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0019  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00333528  normal  0.979216 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0030  tRNA-Lys  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.455261  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0012  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000866174  hitchhiker  0.00954127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0053  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0086  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0209186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0101  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000191032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0009  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0113  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0423055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0012  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013609  normal  0.0833663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0049  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00847785  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0051  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00673114  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0088  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0412207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0046  tRNA-Thr  95.74 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000000451939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>