298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0019 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_R0019  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0045  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.372348 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0933742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0024  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.746229  normal  0.0497689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00039  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000221447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00040  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0035  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0036  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2775  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.466623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2670  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0062  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04529  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000000942406  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_003295  RS04531  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000151858  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0050  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0059  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4597  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0060  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00115408  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0059  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0038  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000499676  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0027  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000168426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0030  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000620846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0064  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.478576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2646  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0017  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000742006  normal  0.411264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0022  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2546  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0594848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0056  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0181776  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0051  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0041  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00270764  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0060  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0168409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0039  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000491618  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1301  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00804048  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2645  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0670079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2554  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2603  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0057  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00550972  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0029  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000636082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0032  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000439194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0455  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.654471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2776  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.453071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3627  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2547  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.03374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0187  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0063  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0041  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148903  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4680  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4679  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870415  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2008  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5047  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000162268  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1300  hypothetical protein  87.67 
 
 		 147 bp  73.8  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00987773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5048  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000423557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0042  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0040  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00260551  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0047  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00354694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2968  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00156309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2969  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0013859  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2604  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0335338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0020  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.342024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0014  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000183317  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2669  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0010  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3626  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2555  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000235232  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0062  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.435087  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0031  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0723333  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0012  tRNA-Ala  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.453962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0013  tRNA-Ala  87.69 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0011  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0029  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.180945  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0042  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0042  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0024  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134353 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04600  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0048  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.152542 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08330  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0848374 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000000354338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0053  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0028  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.0000000000000054137  normal  0.608945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0044  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2625  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2626  hypothetical protein  87.93 
 
 		 1470 bp  60  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000164664  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3137t  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00236079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0066  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000021471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2486  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2459  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0051  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0035  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0016  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0045  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000205649  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0092  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000000431101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0049  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.661163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0087  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00553547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0091  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000134168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0093  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000010191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0098  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000110088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0050  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000169071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1375  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000019852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0018  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.867463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>