More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_R0010 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_R0046  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0258027  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0005  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314904 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.407573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057492  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00326143  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0005  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t04  tRNA-Ala  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0041  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0004  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.892843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0003  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00134196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0005  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000781338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0010  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0005  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000213903  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0005  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309282  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127609 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309290  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0020  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0048  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.544704  hitchhiker  0.00053111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0056  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0061  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0008  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0953331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0032  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.168105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0037  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0051  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0021  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000106448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0034  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000564918  normal  0.218531 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0021  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.984556  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0050  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0058  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0063  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0003  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0009  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0082  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0027  tRNA-Ala  96.23 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309089  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0019  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.399377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309372  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.272937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309204  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72887  normal  0.842293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0004  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0038  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309163  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309140  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0011  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0020  tRNA-Ala  96.08 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0182  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0014  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0169  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0072  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.01367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0037  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0037  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0010  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t29  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t31  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0003  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.070805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0002  tRNA-Ala  94.34 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0039  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA36  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA38  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851121  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0041  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0636835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0035  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0025  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.156326  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0001  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0032  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0018  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0308139  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0049  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0038  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0013  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0036  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0041  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.239536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0014  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0045  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2178  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2450  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0080  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0004  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108101  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0020  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.71083e-16  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0029  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000220959  unclonable  0.000000053075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0041  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000493148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1799  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.53202e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1805  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000574761 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0002  tRNA-Ala  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3082  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0011  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454361  hitchhiker  0.00914283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>