117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30530  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.601239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0053  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000600525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14015  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00298492  normal  0.41958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0043  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0023  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0045  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0042  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.23769  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0042  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0052  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0019  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.23026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0053  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0033  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0034  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0047  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11600  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.589046 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23850  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1359  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0011  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00874285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13160  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.10655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0017  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6031  tRNA-Val  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.54533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0027  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0770393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0028  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0970246  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  88.71 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0040  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0019  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0003  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10591  normal  0.264536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0039  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0054  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.243452  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0038  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0043  tRNA-Ala  97.22 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1441  tRNA-Ala  88.33 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000019523  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0027  tRNA-Val  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.532393  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0012  tRNA-Val  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0269943 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0011  tRNA-Ala  85.33 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0024  tRNA-Ala  85.33 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.831109  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0064  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0296327  normal  0.0688204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0009  tRNA-Ala  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0016  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00234368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0044  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.695473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0049  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0075  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19780  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32630  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.319038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0052  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00190708  normal  0.716322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0051  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0050  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0674912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0045  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0148496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0009  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2507  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2773  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0009  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0078  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2213  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2460  tRNA-Ala  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0018  tRNA-Ala  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t18  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000569276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0038  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0040  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.90959  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0013  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0012  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.556924 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0073  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0036  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120511 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1352  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16810  tRNA-Val  92.86 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606714  normal  0.0176901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0033  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0047  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00129328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0040  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.403518  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0016  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0057  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.185628  hitchhiker  0.000293533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0062  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0469123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0067  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000523585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0072  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.064194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0048  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000617749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0045  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.215104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0049  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594982  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0029  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.978783  normal  0.786802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0064  tRNA-Ala  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.805533 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0071  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0933742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0086  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0087  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.456673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0002  tRNA-Ala  84.13 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353187  normal  0.0609648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0058  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0053  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0055  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0004  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0037  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0234109  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07860  tRNA-Ala  82.67 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>