More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2213 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2507  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2773  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0078  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2213  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2460  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0058  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0004  tRNA-Ala  95.65 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0037  tRNA-Ala  95.65 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0234109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0006  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0010  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.560104  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0059  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0037  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00177627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0083  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000917058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0013  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000368246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0067  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00925323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0008  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0040  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0690466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0016  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 73 bp  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0028  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 73 bp  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0068  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 73 bp  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt02  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt11  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt02  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt11  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0062  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0469123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0057  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.185628  hitchhiker  0.000293533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0016  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0072  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.064194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0067  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000523585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0020  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0040  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000841644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0063  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.808449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0008  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000809396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0022  tRNA-Ala  97.92 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000459218  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0080  tRNA-Ala  97.92 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0072  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000540506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0050  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00215399  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0018  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0020  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0056  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0061  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  91.8 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0020  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.18478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0071  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0030  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0046  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0017  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0394632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0035  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0023  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0034  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0822071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0052  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00134949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0062  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.128618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0072  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.821542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0044  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0050  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0340  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0346  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0557  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0563  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3906  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0002  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00133969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0009  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0632533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0017  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0175356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0024  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.022651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0082  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000141223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0034  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0018  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03615  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4844  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054319  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6151  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00201  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00328  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0050  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0108182  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00195  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5401  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0384247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0016  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03719  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0003  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0009  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292395  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0080  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0030  tRNA-Ala  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0007  tRNA-Ala  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0023  tRNA-Ala  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0030  tRNA-Ala  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.284622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0076  tRNA-Ala  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0083  tRNA-Ala  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0813  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0031  tRNA-Ala  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044944  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt023  tRNA-Ala  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00025586  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0001  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0032  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0018  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0308139  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0049  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0742  tRNA-Ala  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08590  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>