More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0020 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_R0020  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000841644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309372  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.272937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309089  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309204  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72887  normal  0.842293 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309140  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0004  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0038  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309163  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0011  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0020  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0019  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.399377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0063  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.808449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0050  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.903687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0055  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0072  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000540506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0008  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000809396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0084  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0403496  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla01  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0017  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161415  hitchhiker  0.00407434 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0022  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000459218  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0128  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000050642  normal  0.0403899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0103  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000241452  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0627  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351596  normal  0.0173581 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0004  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000571046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0047  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000145993  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla02  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0469  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000319828  normal  0.0257822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4205  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4292  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000724507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4264  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000257856  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0021  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000106448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0034  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000564918  normal  0.218531 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0060  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000375554  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0080  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0008  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0953331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0032  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.168105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0037  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0051  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309290  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309282  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0041  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00109755  normal  0.386448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0008  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00866948  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238742  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0003  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.897638  normal  0.0843141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0032  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2460  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0080  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0013  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2213  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0015  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0078  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0009  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0009  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292395  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0009  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2507  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2773  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0008  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000983847  hitchhiker  0.000163043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0091  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000036342  hitchhiker  0.00439232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0011  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000293397  hitchhiker  0.000919348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0006  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138481  normal  0.649612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0054  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00629084  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t04  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t10  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t16  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.266667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t41  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t62  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.132362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0023  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000263771  hitchhiker  0.000576138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA15  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140136  normal  0.0102335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA50  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000979507  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA6  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0168581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA72  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA81  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00142149  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R14  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000817824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R3  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00599738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R43  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000550301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R58  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R79  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916269  hitchhiker  0.00756682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R92  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000124955  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0033  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000292455  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0062  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000746222  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0060  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273656  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0078  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000280494  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0015  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00408326  hitchhiker  0.00315011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0097  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000376718  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0186  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t69  tRNA-Ala  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.595714  hitchhiker  0.00914053 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2101  hypothetical protein  88.16 
 
 		 228 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000210975  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0040  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0050  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0340  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0346  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0557  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2102  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000104727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2625  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2626  hypothetical protein  88.16 
 
 		 1470 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000164664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R34  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>