More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0034 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0034  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0037  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0234109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0004  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0058  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0028  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0068  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0016  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt02  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt11  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt02  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt11  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0010  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.560104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0002  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0011  tRNA-Ala  97.73 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454361  hitchhiker  0.00914283 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0386  tRNA-Ala  97.73 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0050  tRNA-Ala  97.73 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.142623  normal  0.530513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0009  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2507  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2773  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0009  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0078  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2213  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2460  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3082  tRNA-Ala  97.73 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0033  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0587853  normal  0.374695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0067  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00925323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0050  tRNA-Ala  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00215399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0040  tRNA-Ala  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0690466  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0051  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124425  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0062  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.669958  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0018  tRNA-Ala  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0058  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0350948  hitchhiker  0.00476067 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0010  tRNA-Ala  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00600624  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0072  tRNA-Ala  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.064194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0067  tRNA-Ala  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000523585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0004  tRNA-Ala  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000194526  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0016  tRNA-Ala  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0062  tRNA-Ala  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0469123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0010  tRNA-Ala  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000320815  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0057  tRNA-Ala  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.185628  hitchhiker  0.000293533 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0004  tRNA-Ala  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000388071  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0028  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408156  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t32  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.318982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t37  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00721336  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0013  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000368246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0028  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.139647  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0027  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0013  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0030  tRNA-Ala  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0001  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0032  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0018  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0308139  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0049  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0006  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0066  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00138372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0033  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0037  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00177627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0008  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0083  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000917058  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0059  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6555  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0040  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0056  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0058  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4552  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566095  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0030  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.915184  normal  0.110132 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0034  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6552  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0038  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0047  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0056  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0014  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0634933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4580  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0046  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0048  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0039  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0737446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0045  tRNA-Ala  97.67 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000176076  normal  0.226339 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0049  tRNA-Ala  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0005  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0010  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.407573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0005  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000213903  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4325  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00976587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0005  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0010  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057492  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0010  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0046  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195569  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0051  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0057  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0063  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0025  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1834  tRNA-Ala  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>