More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0742 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0742  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt023  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00025586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0046  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0071  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0030  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0020  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.18478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0061  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0017  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0394632  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0083  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0007  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0072  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.821542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0056  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0020  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0035  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0076  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0030  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.284622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0023  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0057  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0003  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000778688  normal  0.0120453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5644  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5625  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0026  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0540884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0089  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139487  normal  0.187722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna51  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000980823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0103  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00163997  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0050  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326292 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0026  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0248198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0038  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0033  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.362537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5641  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0004  tRNA-Ala  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108101  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0020  tRNA-Ala  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.71083e-16  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0029  tRNA-Ala  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000220959  unclonable  0.000000053075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0041  tRNA-Ala  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000493148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0004  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4325  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00976587  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4349  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271842  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4354  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.118152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0010  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0065  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0065  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0008  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0425989  normal  0.0119872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna58  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000146437  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0052  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0059  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0003  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0051  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0057  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0063  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0084  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000245479  normal  0.337418 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5618  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0009  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0348385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5311  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0029  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0008  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5287  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.231328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0003  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00193312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0013  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000457589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0057  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0077  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000402465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0085  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00934773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0010  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05584  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00134136  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_003296  RS05382  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151411  normal  0.0932844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5732  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000677485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-4  tRNA-Val  94.83 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000645962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000288872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-1  tRNA-Val  94.83 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0417532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-3  tRNA-Val  94.83 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000052933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-4  tRNA-Val  94.83 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00757095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-5  tRNA-Val  94.83 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-6  tRNA-Val  94.83 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000716932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-5  tRNA-Val  94.83 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000106447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0061  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210957  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0072  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00338762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0080  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0573035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0011  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0039  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000177246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0006  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118096  hitchhiker  0.00000272915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0008  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000503883  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0050  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0060  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0011  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.620126  normal  0.156635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0028  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101563  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0063  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0014  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.55572e-16  normal  0.0217689 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0077  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000753043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>