More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4325 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_R0065  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0065  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0059  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4325  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00976587  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4349  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271842  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4354  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.118152  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0063  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0038  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0084  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000245479  normal  0.337418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0003  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000778688  normal  0.0120453 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna58  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000146437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0008  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0425989  normal  0.0119872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0089  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139487  normal  0.187722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna51  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000980823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0003  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0009  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0082  tRNA-Ala  97.33 
 
 		 76 bp  133  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0072  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.01367  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0010  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00600624  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0010  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000320815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0010  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177637  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0004  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000388071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0003  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.070805  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0004  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000194526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0035  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0025  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.156326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0041  tRNA-Ala  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0636835  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0009  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000731062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0041  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0709552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0006  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0860739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0011  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.193139  normal  0.133058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0022  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0030  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.915184  normal  0.110132 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0654  tRNA-Ala  98.33 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt023  tRNA-Ala  94.44 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00025586  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1372  tRNA-Ala  98.33 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0012  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0056  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0020  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0070  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.756512  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t32  tRNA-Ala  96.83 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.318982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t37  tRNA-Ala  96.83 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00721336  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0004  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108101  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0020  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.71083e-16  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0029  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000220959  unclonable  0.000000053075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0041  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000493148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05584  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00134136  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_003295  RS05733  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746893  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2450  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0063  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0048  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0010  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081559  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0051  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0061  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210957  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0072  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00338762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0080  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0573035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0011  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0039  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000177246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0060  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0004  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000214056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0039  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0737446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0056  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0009  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275815  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0014  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.55572e-16  normal  0.0217689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0028  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101563  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0006  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118096  hitchhiker  0.00000272915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0053  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0417957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0008  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000503883  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0052  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000131419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0062  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0072  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0130788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0077  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000753043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0050  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0018  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0006  tRNA-Ala  98.25 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>