More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_R0023 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_R0083  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0023  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0007  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0076  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0030  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.284622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0035  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0020  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0020  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.18478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0072  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.821542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0056  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0061  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0030  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0071  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0003  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0022  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0054  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0077  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0046  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0017  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0394632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0062  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.128618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0023  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0052  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00134949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0034  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0822071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0030  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.915184  normal  0.110132 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0066  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00138372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0033  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0013  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0032  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0119257  normal  0.670174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0013  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0119522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0044  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.541664  hitchhiker  0.000000158432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0027  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0052  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0742  tRNA-Ala  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0004  tRNA-Ala  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108101  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0020  tRNA-Ala  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.71083e-16  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0029  tRNA-Ala  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000220959  unclonable  0.000000053075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0041  tRNA-Ala  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000493148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0015  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0358184  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0049  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000677236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0003  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0013  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0014  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0634933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0016  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0034  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt02  tRNA-Ala  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt11  tRNA-Ala  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt02  tRNA-Ala  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt11  tRNA-Ala  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0046  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0008  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000809396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0063  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.808449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0072  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000540506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3770  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000042375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0018  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000940712  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0034  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000978021  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0084  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0103479  hitchhiker  0.00836377 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0065  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118515  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0019  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000594786  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0700  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3541  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000166638  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0073  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010324  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0593  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00108095  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0079  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000825474  normal  0.0444964 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0063  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000409772  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0021  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000715595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0085  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0009  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000573658  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0088  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000179192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000191328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1339  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0452  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000943072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0003  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1475  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000234459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3560  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1910  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000831958  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_R0081  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000215983  normal  0.0761236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0074  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018375  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0067  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0125771  normal  0.986623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0006  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000243293  hitchhiker  0.00235308 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0927  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000140839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1330  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1989  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000370393  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0082  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000696423  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2045  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1098  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000248852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2896  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000192555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3093  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0496  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554193  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1896  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000338005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3542  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00175783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>