More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lppt11 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lppt02  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt11  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt02  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt11  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0040  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0690466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0067  tRNA-Ala  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00925323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4844  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054319  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5401  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0384247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6151  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0018  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0050  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0108182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0813  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60170  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000756055  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60010  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0174711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60350  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.094178  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60100  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60560  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0012077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60390  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0878847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70890  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.419729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08590  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55634  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.269014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62070  tRNA-Ala  93.94 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0133528  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0006  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0059  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0009  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2507  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2773  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0009  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0078  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2213  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2460  tRNA-Ala  98.04 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0058  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0037  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0234109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0004  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0010  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.560104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0023  tRNA-Ala  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0044  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0050  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0340  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0346  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0557  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0563  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3906  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0007  tRNA-Ala  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0083  tRNA-Ala  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0076  tRNA-Ala  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0030  tRNA-Ala  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.284622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0002  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00133969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0009  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0632533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0017  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0175356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0024  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.022651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0082  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000141223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0008  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0083  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000917058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0034  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0013  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000368246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0037  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00177627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0020  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.18478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0046  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0056  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0034  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0822071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0062  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.128618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0023  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00683735  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00328  tRNA-Ala  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00201  tRNA-Ala  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0072  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.821542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0394632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0020  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0071  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0061  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03719  tRNA-Ala  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0030  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03615  tRNA-Ala  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0035  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00195  tRNA-Ala  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00134949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0058  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0003  tRNA-Ala  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4552  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0056  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0038  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0048  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0049  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0056  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6555  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0047  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0040  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0039  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0737446 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0008  tRNA-Ala  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000809396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0063  tRNA-Ala  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.808449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0072  tRNA-Ala  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000540506  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6552  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0016  tRNA-Ala  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4580  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0091  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000036342  hitchhiker  0.00439232 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0003  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0062  tRNA-Ala  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000746222  normal  0.783318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>