More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_60560 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4844  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60010  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0174711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60560  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0012077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60350  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.094178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0108182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6151  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60390  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0878847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60170  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000756055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5401  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0384247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0813  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60100  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08590  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000156389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55634  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.269014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62070  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70890  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.419729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0133528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0080  tRNA-Ala  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00204855  normal  0.185983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0072  tRNA-Ala  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000523195  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0010  tRNA-Ala  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0704322  hitchhiker  0.00208971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0036  tRNA-Ala  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000936293  normal  0.188106 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0016  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0062  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0469123  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t10  tRNA-Ala  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922263  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t49  tRNA-Ala  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t69  tRNA-Ala  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.595714  hitchhiker  0.00914053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0015  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00408326  hitchhiker  0.00315011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0078  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000280494  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0097  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000376718  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00195  tRNA-Ala  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0006  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138481  normal  0.649612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0023  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000263771  hitchhiker  0.000576138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03615  tRNA-Ala  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0054  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00629084  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0044  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0050  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0340  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0346  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0557  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0563  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3906  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0011  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000293397  hitchhiker  0.000919348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t04  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t10  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t16  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.266667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t41  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t62  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.132362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0060  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273656  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00201  tRNA-Ala  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0057  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.185628  hitchhiker  0.000293533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0091  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000036342  hitchhiker  0.00439232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0072  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.064194  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0067  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000523585  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0062  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000746222  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0033  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000292455  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA15  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140136  normal  0.0102335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA50  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000979507  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA6  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0168581  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA72  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000170851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA81  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00142149  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R14  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000817824  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R3  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00599738  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R43  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000550301  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R58  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367704  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R79  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916269  hitchhiker  0.00756682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R92  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000124955  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0008  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000983847  hitchhiker  0.000163043 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00328  tRNA-Ala  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03719  tRNA-Ala  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0084  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0057  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646695 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0065  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0073  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.153507 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0004  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0028446  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0002  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00133969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0009  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0632533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0017  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0175356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0024  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.022651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0082  tRNA-Ala  93.15 
 
 
76 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000141223  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt02  tRNA-Ala  93.94 
 
 
76 bp  99.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt11  tRNA-Ala  93.94 
 
 
76 bp  99.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt02  tRNA-Ala  93.94 
 
 
76 bp  99.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt11  tRNA-Ala  93.94 
 
 
76 bp  99.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0182  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0080  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2178  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2450  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  95.08 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>