70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0056 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0056  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0042  tRNA-Pro  87.69 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0029  tRNA-Pro  88.41 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0071  tRNA-Pro  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0705665  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0022  tRNA-Pro  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414073  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0282  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000340373  hitchhiker  0.0000247007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13260  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0382436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0033  tRNA-Pro  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0005  tRNA-Pro  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0053  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000194568  unclonable  8.89969e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0077  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.98508e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0052  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0014  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0019  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0018  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.471036  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0007  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t42  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000750468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0027  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.719402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309295  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0017  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0010  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0051  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0997799  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0005  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240002  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0006  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14040  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0988532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0042  tRNA-Pro  86.79 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0057  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0045  tRNA-Pro  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000186753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0049  tRNA-Ile  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0012  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0041  tRNA-Pro  86.54 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0047  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0056  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.764712  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.319712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0010  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0016  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0038  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0019  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0060  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0545385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0067  tRNA-Pro  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.588797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0014  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0053  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379391  normal  0.108356 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0164  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0001  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0004  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000393504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0053  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00100217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0009  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0035  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0029  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0050  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0043  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0170855  normal  0.349798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0051  tRNA-Pro  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0002  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0055  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0071  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000011229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>