15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0052 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0028  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926195  normal  0.035685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0052  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0032  tRNA-Asp  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0055  tRNA-Asp  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0030  tRNA-Asp  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.787205  normal  0.479074 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0049  tRNA-Asp  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000227273  decreased coverage  0.00000000261131 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0050  tRNA-Asp  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000210067  decreased coverage  0.00000000256467 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0052  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.914226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0036  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0086  tRNA-Asp  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0155365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0016  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0031  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0054  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000217975  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0087  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>