More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0039 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0039  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2828  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000743233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2829  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2830  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000136674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2831  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000125741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2832  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2833  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000102319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0030  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0043  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0066  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000193579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00045  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0997281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00064  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0611511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00073  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.101192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00078  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00645399  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0028  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0089  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0392203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0097  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0112  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000205577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0105  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00614062  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0083  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000720512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0036  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000509558  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4416  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000380054  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0081  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000920417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5055  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0897941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0067  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000550936  normal  0.0102746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0008  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.029159  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0107  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0341166  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0087  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00145961  normal  0.0492727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4586  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000616309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4716  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000625265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4686  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0982037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0040  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115197  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0041  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00117602  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3591  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000586916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4707  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0110  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000208441  normal  0.204301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0075  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000263239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0073  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000527545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0109  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000218236  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0104  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.597387  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3593  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0242982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0080  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0129  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00335623  normal  0.0126805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4458  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0692997  hitchhiker  0.00363105 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0077  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000145614  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4102  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4389  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  0.7898 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2769  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00441704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4327  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000475323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3056  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0721496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0043  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0177795  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2873  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.174339  normal  0.2866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4911  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00060997  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4173  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00665107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3665  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0302552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4512  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00641389  normal  0.576073 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3699  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0040697  normal  0.0437365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2874  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.403763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4465  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000990931  hitchhiker  0.00000000000884096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4510  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0115463  normal  0.0174598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4223  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0747628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2853  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0537203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5097  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000188223  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5082  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0023409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4721  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00309501  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0104  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0156595  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0106  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00248374  normal  0.1959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5105  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0706149  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2744  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0202899  normal  0.795242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0112  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000133655  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0111  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000137608  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0108  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0072  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000259101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0076  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0074  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000046104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0113  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000136278  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0107  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000800157  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0084  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000679544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0082  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0079  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0112  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010822  hitchhiker  0.00272786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0032  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829453  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4117  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0976755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0078  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000635495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4233  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000331616  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4125  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00109058  normal  0.113801 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4423  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3762  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00180196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0039  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037327  normal  0.202032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0038  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000255678  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0037  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000218875  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0045  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0637715  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4502  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00140691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0044  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369113  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0042  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353157  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0046  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113543  normal  0.2002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>