299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_R0030 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032688  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0066  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000193579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0039  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0036  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000509558  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0037  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000218875  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0109  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000218236  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0112  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000133655  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0072  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000259101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0075  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000263239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0076  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0040  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115197  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0043  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0177795  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0111  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000137608  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0073  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000527545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0113  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000136278  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0074  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000046104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0077  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0083  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000720512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0108  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0110  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000208441  normal  0.204301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0081  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000920417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0080  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0082  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0079  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0045  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0637715  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0039  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037327  normal  0.202032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0084  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000679544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0078  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000635495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0038  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000255678  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0044  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369113  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0042  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353157  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0046  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113543  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0104  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0156595  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0105  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00614062  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0107  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000800157  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0106  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00248374  normal  0.1959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0041  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00117602  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGluVIMSS1309378  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGluVIMSS1309151  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0730688  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0010  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0011  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.267714  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0024  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGluVIMSS1309075  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGluVIMSS1309126  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGluVIMSS1309208  tRNA-Glu  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.689492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0007  tRNA-Glu  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0043  tRNA-Glu  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0945053  normal  0.0751648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0059  tRNA-Glu  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0106  tRNA-Glu  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.608719  normal  0.0144699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0022  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2009  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0041  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0186  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0007  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183145  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0043  tRNA-Glu  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0026  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.307498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0026  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.062518  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGluVIMSS1309264  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0090  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00252  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2541  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000144493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t066  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t068  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t069  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t071  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00377  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2337  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0084  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000274947  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0086  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0085  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0089  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000367651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0068  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000101886  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0070  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000026178  normal  0.0123268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0063  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000852764  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0065  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000829998  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0066  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.663718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0067  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000412805  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0068  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000473191  normal  0.85687 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00466  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06831  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0074  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0075  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>