More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_R0036 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_R0036  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000509558  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0044  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369113  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0046  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113543  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0081  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000920417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0082  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0110  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000208441  normal  0.204301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0109  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000218236  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0112  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000133655  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0077  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0113  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000136278  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0111  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000137608  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0079  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0078  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000635495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0076  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131941  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0105  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00614062  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0104  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0156595  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0106  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00248374  normal  0.1959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0107  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000800157  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0108  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0037  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000218875  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0038  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000255678  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0039  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037327  normal  0.202032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0041  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00117602  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115197  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0042  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353157  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0043  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0177795  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0045  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0637715  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0080  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0083  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000720512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0073  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000527545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0072  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000259101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0084  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000679544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0075  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000263239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0074  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000046104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0007  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0043  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0945053  normal  0.0751648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0059  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0106  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.608719  normal  0.0144699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0074  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0101  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000061614  normal  0.113768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0084  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000274947  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0073  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000261854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0098  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000377978  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0089  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000367651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0086  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t065  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t066  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t067  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t068  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t069  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t071  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0090  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0076  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0095  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00314986  normal  0.201708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0097  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121483  normal  0.112474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0096  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00116613  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0099  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000375203  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0072  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0087  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0085  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0083  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00174717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0071  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000687617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0070  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00169817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0068  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000101886  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0070  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000026178  normal  0.0123268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0063  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000852764  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0065  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000829998  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0066  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.663718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0067  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000412805  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0068  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0069  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000472024  normal  0.658468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0070  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000548592  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0102  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000600176  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0069  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0164971  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0061  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0063  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000126718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0064  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000354559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0065  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0066  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000460024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0067  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0068  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000473191  normal  0.85687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0074  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0075  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0076  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0078  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00140572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0080  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000593448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0081  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000080757  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2009  tRNA-Glu  98.59 
 
 		 76 bp  133  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t041  tRNA-Glu  97.33 
 
 		 76 bp  133  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000012755  normal  0.0206852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t043  tRNA-Glu  97.33 
 
 		 76 bp  133  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011621  normal  0.0207862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t045  tRNA-Glu  97.33 
 
 		 76 bp  133  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108863  normal  0.0209012 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0186  tRNA-Glu  98.59 
 
 		 76 bp  133  6e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>