299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_R0034 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 75 bp  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  98.63 
 
 		 72 bp  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  98.63 
 
 		 72 bp  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  97.26 
 
 		 76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0030  tRNA-Glu  97.22 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0242042  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0029  tRNA-Glu  97.22 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  hitchhiker  0.000705455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0032  tRNA-Glu  97.22 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00151707  hitchhiker  0.000680514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0053  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 75 bp  119  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0017  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1600  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0070  tRNA-Glu  95.45 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  0.130321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0022  tRNA-Glu  95.45 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0030  tRNA-Glu  95.45 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.437879  normal  0.359781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0002  tRNA-Glu  95.45 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.0346433 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t34  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907157  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0033  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.150537  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0032  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519477  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0094  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.115481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0023  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707978  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0084  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0113  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000136278  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0109  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000218236  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0081  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000920417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0046  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113543  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0042  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353157  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0079  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0107  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000800157  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0074  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000046104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0072  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000259101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0110  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000208441  normal  0.204301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0082  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0040  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115197  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0039  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037327  normal  0.202032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0080  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0104  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0156595  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0108  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0106  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00248374  normal  0.1959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0112  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000133655  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0075  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000263239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0073  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000527545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0111  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000137608  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0105  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00614062  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0078  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000635495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0084  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000679544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0036  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000509558  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0083  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000720512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0077  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000145614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0043  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0177795  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0041  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00117602  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0038  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000255678  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0045  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0637715  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0044  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369113  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0037  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000218875  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0076  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131941  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0021  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.228053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0030  tRNA-Glu  92.54 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0024  tRNA-Glu  92.06 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0050  tRNA-Glu  92.06 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0011  tRNA-Glu  92.06 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000477421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2009  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0186  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0009  tRNA-Glu  92.42 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0012  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0004  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0030  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0007  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0043  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0945053  normal  0.0751648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0059  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0106  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.608719  normal  0.0144699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0034  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2828  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000743233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2829  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2830  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000136674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2831  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000125741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2832  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2833  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000102319  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0038  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000438841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t33  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA39  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783995  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA58  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237213  normal  0.68605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA60  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.095942  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  89.39 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0055  tRNA-Glu  89.39 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380229  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>