More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_R0030 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  98.7 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  98.7 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  98.7 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0186  tRNA-Glu  97.4 
 
 		 76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2009  tRNA-Glu  97.4 
 
 		 76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0039  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00037327  normal  0.202032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0043  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0177795  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0040  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115197  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0112  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000133655  normal  0.209222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0111  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000137608  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0045  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0637715  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0074  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000046104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0084  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000679544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0082  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0079  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0076  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131941  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0109  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000218236  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0036  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000509558  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0041  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00117602  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0044  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369113  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0042  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353157  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0046  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113543  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0104  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0156595  normal  0.197375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0037  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000218875  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0038  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000255678  normal  0.198385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0107  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000800157  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0108  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0106  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00248374  normal  0.1959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0072  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000259101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0113  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000136278  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0105  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00614062  normal  0.200488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0110  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000208441  normal  0.204301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0075  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000263239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0073  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000527545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0078  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000635495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0077  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0080  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000255238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0081  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000920417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0083  tRNA-Glu  98.61 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000720512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0002  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0220588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0036  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000110474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0010  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373505  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0066  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0228326  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4216  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133179  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4194  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000043379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4190  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00029698  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0009  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000494179  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4284  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489125  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0053  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.646689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0046  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118448  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0049  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000939786  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0034  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00458122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0008  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.114306  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0036  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0894618  normal  0.0649973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0038  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000180021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0097  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000137842  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0102  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0014  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000370587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1919  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  normal  0.292752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0108  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0206919  unclonable  0.0000000263061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0045  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000328054  normal  0.0346347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0055  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380229  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0012  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0039  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000141026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0035  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000448273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0037  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000193498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0086  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0077  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0002  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00548293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0094  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.453938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3472  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00023531  normal  0.785224 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3401  tRNA-Glu  96.1 
 
 		 78 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0670786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0007  tRNA-Glu  97.22 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0043  tRNA-Glu  97.22 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0945053  normal  0.0751648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0059  tRNA-Glu  97.22 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0106  tRNA-Glu  97.22 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.608719  normal  0.0144699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00064  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0611511  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0028  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0089  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0392203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2830  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000136674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2831  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000125741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2832  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2833  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000102319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt26  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt27  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt26  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt27  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0107  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0341166  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0087  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00145961  normal  0.0492727 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu01  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 79 bp  113  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.484379  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu02  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 79 bp  113  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu03  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 79 bp  113  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0067  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000550936  normal  0.0102746 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0094  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000925295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0096  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0097  tRNA-Glu  94.81 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000012419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>