298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA_tRNA-Glu-1 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0026  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.307498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0053  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.646689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0045  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000328054  normal  0.0346347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0055  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380229  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0026  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.062518  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt26  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt27  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt26  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt27  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2128  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0032  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.362082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0046  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118448  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0049  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000939786  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0002  tRNA-Glu  98.33 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9841800000000004e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0004  tRNA-Glu  98.33 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.0060400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00045  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0997281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00064  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0611511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00073  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.101192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00078  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00645399  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0028  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0089  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0392203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0097  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0112  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000205577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00679153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0059  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917431  normal  0.553022 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0032  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829453  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4512  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00641389  normal  0.576073 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5105  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0706149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2009  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3762  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00180196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5478  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00757172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0099  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000015218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0050  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.517089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0129  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00335623  normal  0.0126805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0045  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3665  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0302552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4458  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0692997  hitchhiker  0.00363105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4465  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000990931  hitchhiker  0.00000000000884096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3591  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000586916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5193  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5433  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000105127  normal  0.0151681 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4586  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000616309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0001  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0034  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0008  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.029159  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0112  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010822  hitchhiker  0.00272786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0107  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0341166  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0087  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00145961  normal  0.0492727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0067  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000550936  normal  0.0102746 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4223  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0747628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu01  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.484379  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu02  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu03  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0186  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0104  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.597387  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4327  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000475323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2873  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.174339  normal  0.2866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0021  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00556974  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4233  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000331616  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4416  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000380054  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4707  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4721  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00309501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4716  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000625265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4686  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0982037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4125  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00109058  normal  0.113801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5097  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000188223  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5082  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0023409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3593  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0242982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5055  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0897941  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2874  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.403763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2769  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00441704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2744  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0202899  normal  0.795242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4389  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  0.7898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4510  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0115463  normal  0.0174598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4117  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0976755  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2987  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4423  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3699  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0040697  normal  0.0437365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0087  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000979813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4282  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2853  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0537203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0047  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374148  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3830  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00526178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4102  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0079  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4173  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00665107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3056  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0721496  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0057  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000756674  normal  0.548722 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0022  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0022  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4502  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00140691  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0055  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101693  normal  0.730333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4911  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00060997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>