More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_R0129 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_t00045  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0997281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00064  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0611511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00073  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.101192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00078  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00645399  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0028  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0089  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0392203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0097  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0112  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000205577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4686  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0982037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4707  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4716  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000625265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4721  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00309501  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4102  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5193  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411185  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4282  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611024  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2853  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0537203  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0104  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.597387  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0079  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4458  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0692997  hitchhiker  0.00363105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4125  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00109058  normal  0.113801 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2873  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.174339  normal  0.2866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4911  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00060997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2874  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.403763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4465  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000990931  hitchhiker  0.00000000000884096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0107  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0341166  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4233  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000331616  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5105  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0706149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5097  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000188223  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3830  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00526178  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3591  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000586916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5433  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000105127  normal  0.0151681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0094  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4416  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000380054  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3056  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0721496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4327  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000475323  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4117  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0976755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0129  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00335623  normal  0.0126805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0087  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00145961  normal  0.0492727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0067  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000550936  normal  0.0102746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0008  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.029159  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0099  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0389397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4173  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00665107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4512  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00641389  normal  0.576073 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3665  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0302552  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4510  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0115463  normal  0.0174598 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4389  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  0.7898 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3593  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0242982  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4223  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0747628  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2744  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0202899  normal  0.795242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2987  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3762  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00180196  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0032  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829453  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0112  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010822  hitchhiker  0.00272786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5082  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0023409  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4423  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0087  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000979813  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2769  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00441704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5478  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00757172  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0060  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0296657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0021  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00556974  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0099  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000015218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0086  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0185874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0032  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584349  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4502  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00140691  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3699  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0040697  normal  0.0437365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4586  tRNA-Glu  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000616309  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5055  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0897941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0036  tRNA-Glu  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000110474  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0037  tRNA-Glu  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000193498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0034  tRNA-Glu  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00458122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0066  tRNA-Glu  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0228326  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0102  tRNA-Glu  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0035  tRNA-Glu  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000448273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0002  tRNA-Glu  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0220588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0086  tRNA-Glu  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0088  tRNA-Glu  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00276432  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0090  tRNA-Glu  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102507  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0092  tRNA-Glu  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000105241  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0094  tRNA-Glu  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000925295  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0095  tRNA-Glu  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0096  tRNA-Glu  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000128006  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0097  tRNA-Glu  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000012419  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t065  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t066  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0069  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0164971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0084  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000274947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0068  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000101886  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0070  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000026178  normal  0.0123268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0063  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000852764  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0065  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000829998  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0075  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0078  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00140572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0080  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000593448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0081  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000080757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>