13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0032 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0032  tRNA-Glu  100 
 
 		 111 bp  220  6e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0046  tRNA-Glu  97.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0040  tRNA-Glu  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  97.06 
 
 		 75 bp  60  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  97.06 
 
 		 75 bp  60  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0043  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0015  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0154523  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0016  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0048  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.200275 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0048  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>