21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0040 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0040  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0033  tRNA-Gly  96.92 
 
 		 71 bp  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0003  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0439445  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0026  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0002  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0009  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.146506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0037  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 97 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t20  tRNA-Arg  100 
 
 		 124 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0038  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91696  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0037  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362348  normal  0.882649 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0038  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000426137 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0031  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.285038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0008  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000049005  hitchhiker  0.000183919 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0026  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 97 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0066  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306827  normal  0.744796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0063  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0323574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0050  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.559947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>