17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0003 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0439445  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0033  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0040  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0018  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232817  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0002  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0013  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0012  tRNA-Gly  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0007  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0037  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362348  normal  0.882649 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0031  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0029  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0002  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00190124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0023  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.805524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0073  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0583233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0015  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123591 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0025  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 108 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0020  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000277692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>