47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_R0020 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000277692 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0021  tRNA-Ala  95.74 
 
 		 94 bp  155  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0025  tRNA-OTHER  84.26 
 
 		 108 bp  97.6  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0029  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  89.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0015  tRNA-OTHER  97.78 
 
 		 81 bp  81.8  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.321152 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0033  tRNA-OTHER  95.56 
 
 		 109 bp  73.8  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 92 bp  73.8  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0014  tRNA-OTHER  95.56 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 91 bp  73.8  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123591 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0032  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.998395  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0006  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 92 bp  65.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138313  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0025  tRNA-Gly  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0464601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.805604 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.759432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.794494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 		 96 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0008  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000049005  hitchhiker  0.000183919 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0033  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0039  tRNA-Thr  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0474661 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0003  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0439445  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  100 
 
 		 104 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0023  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0777816  normal  0.377314 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0019  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.661812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 101 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.35465  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_1  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0038  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.266869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0012  tRNA-Asp  100 
 
 		 112 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0044  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.335529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0023  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0032  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0003  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 112 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 113 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>