9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0002 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0002  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0037  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362348  normal  0.882649 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0007  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.401989  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0033  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0003  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0439445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0018  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0013  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0040  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0041  tRNA-Gly  86 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.308354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>