60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_R0036 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 
108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 
95 bp  60  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 
75 bp  60  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.794494  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 
75 bp  60  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 
96 bp  60  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  54  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.805604 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  54  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  54  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  54  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.759432  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  54  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0464601  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  91.89 
 
 
75 bp  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 
113 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 
93 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_1  tRNA-OTHER  100 
 
 
108 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 
93 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0038  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.266869  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 
95 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0012  tRNA-Asp  100 
 
 
112 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0044  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.335529  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  100 
 
 
104 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 
101 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.35465  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0039  tRNA-Thr  100 
 
 
92 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0474661 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 
98 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0022  tRNA-OTHER  93.94 
 
 
130 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0025  tRNA-OTHER  88.89 
 
 
122 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 
74 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10375  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0023  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0777816  normal  0.377314 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0018  tRNA-OTHER  100 
 
 
107 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.68509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0012  tRNA-OTHER  100 
 
 
106 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 
105 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 
92 bp  44.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 
117 bp  44.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000377684  decreased coverage  0.000000420741 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0028  tRNA-Asp  100 
 
 
78 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00270528  hitchhiker  0.000366483 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00128122  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0010  tRNA-Ala  88.89 
 
 
77 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.51045  hitchhiker  0.0091927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 
115 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0025  tRNA-OTHER  100 
 
 
108 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  100 
 
 
96 bp  44.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0004  tRNA-Thr  93.33 
 
 
94 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0009  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.146506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  100 
 
 
97 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0009  tRNA-Pro  100 
 
 
112 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.149139  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 
112 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 
72 bp  44.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.905442  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 
94 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000277692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0018  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  100 
 
 
97 bp  44.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 
91 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123591 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0019  tRNA-Gln  100 
 
 
73 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0021  tRNA-Gln  100 
 
 
73 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0029  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0011  tRNA-Lys  100 
 
 
92 bp  44.1  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.106894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0017  tRNA-Ala  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0717588  decreased coverage  0.00491532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>