50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_R0019 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_R0019  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0021  tRNA-Gln  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0029  tRNA-Gln  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0386832 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 112 bp  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0009  tRNA-Pro  100 
 
 		 112 bp  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.149139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0006  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.76195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0006  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0021  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0011  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0004  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0004  tRNA-Gln  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0028  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00270528  hitchhiker  0.000366483 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0021  tRNA-Gln  85.33 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0040  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0001  tRNA-Glu  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0012  tRNA-Asp  100 
 
 		 112 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0038  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.266869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 113 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.905442  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_1  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0044  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.335529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  86.27 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0023  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0777816  normal  0.377314 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0039  tRNA-Thr  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0474661 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0009  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.146506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.35465  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.794494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0018  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 98 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.352421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 		 96 bp  44.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0040  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.805604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.759432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0043  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 68 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0034  tRNA-Met  93.33 
 
 		 99 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0029  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000033077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0464601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  100 
 
 		 104 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>