8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0004 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0004  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.306983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0027  tRNA-Gln  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0044  tRNA-Gln  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0021  tRNA-Gln  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0021  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0011  tRNA-Gln  84 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0019  tRNA-Gln  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0029  tRNA-Gln  82.67 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0386832 
 
 
-
 
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