65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_R0027 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  216  9e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0044  tRNA-OTHER  95.41 
 
 
109 bp  176  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.335529  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0023  tRNA-OTHER  89.91 
 
 
109 bp  129  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0777816  normal  0.377314 
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_1  tRNA-OTHER  87.96 
 
 
108 bp  103  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0039  tRNA-OTHER  82.57 
 
 
95 bp  83.8  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 
113 bp  83.8  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 
93 bp  71.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0012  tRNA-Asp  100 
 
 
112 bp  71.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 
93 bp  63.9  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  63.9  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0038  tRNA-Thr  100 
 
 
77 bp  63.9  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.266869  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0039  tRNA-Thr  100 
 
 
92 bp  63.9  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0474661 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 
74 bp  63.9  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10375  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 
101 bp  60  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.35465  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0003  tRNA-OTHER  90.91 
 
 
112 bp  56  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  96.88 
 
 
93 bp  56  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.5604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0011  tRNA-Ala  96.77 
 
 
72 bp  54  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.759432  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  96.77 
 
 
75 bp  54  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  96.77 
 
 
72 bp  54  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0015  tRNA-Ala  96.77 
 
 
75 bp  54  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.794494  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0042  tRNA-OTHER  96.77 
 
 
96 bp  54  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  96.77 
 
 
72 bp  54  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  96.67 
 
 
101 bp  52  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  96.67 
 
 
109 bp  52  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  96.67 
 
 
96 bp  52  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  96.67 
 
 
108 bp  52  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 
98 bp  52  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  100 
 
 
104 bp  52  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 
108 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0004  tRNA-OTHER  96.55 
 
 
115 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  96.55 
 
 
78 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0009  tRNA-OTHER  100 
 
 
109 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.146506  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0028  tRNA-Asp  100 
 
 
78 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00270528  hitchhiker  0.000366483 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 
72 bp  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.905442  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0018  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29875 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0011  tRNA-Lys  100 
 
 
92 bp  46.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.106894 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.345264 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0004  tRNA-OTHER  96.3 
 
 
117 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000377684  decreased coverage  0.000000420741 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00128122  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 
112 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  100 
 
 
97 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  100 
 
 
96 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  100 
 
 
97 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0464601  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0009  tRNA-Pro  100 
 
 
112 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.149139  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 
95 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_9  tRNA-Cys  96.3 
 
 
111 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  96.3 
 
 
101 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0019  tRNA-Gln  100 
 
 
73 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0021  tRNA-Gln  100 
 
 
73 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 
72 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.805604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0029  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 
94 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000277692 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0025  tRNA-OTHER  100 
 
 
108 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0025  tRNA-OTHER  100 
 
 
122 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0022  tRNA-OTHER  100 
 
 
130 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 
91 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123591 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 
92 bp  44.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>