78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_R0020 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 98 bp  194  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 104 bp  103  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 97 bp  65.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  97.22 
 
 		 96 bp  63.9  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0011  tRNA-Lys  94.87 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.106894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 78 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0007  tRNA-Trp  96.97 
 
 		 112 bp  58  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.31683  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  96.97 
 
 		 97 bp  58  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  94.59 
 
 		 78 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  96.88 
 
 		 109 bp  56  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  96.88 
 
 		 108 bp  56  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  96.88 
 
 		 96 bp  56  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_1  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  52  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  52  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 113 bp  52  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0038  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.266869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0012  tRNA-Asp  100 
 
 		 112 bp  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0044  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  52  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.335529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 101 bp  52  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.35465  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  88 
 
 		 101 bp  52  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0023  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  52  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0777816  normal  0.377314 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  52  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  52  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  88 
 
 		 101 bp  52  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0039  tRNA-Thr  100 
 
 		 92 bp  52  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0474661 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  52  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0031  tRNA-OTHER  93.94 
 
 		 97 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000256784  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0005  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00128122  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  88.64 
 
 		 101 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  90 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0022  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 130 bp  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0025  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 122 bp  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0018  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.29875 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0004  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000377684  decreased coverage  0.000000420741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.794494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 		 96 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0004  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.759432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0464601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.805604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 78 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0050  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.897689  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0004  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0009  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.146506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 101 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0024  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0009  tRNA-Pro  100 
 
 		 112 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.149139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  MSED_1  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 112 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0018  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.355045  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.905442  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000277692 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0025  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123591 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0017  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.5604 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0028  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00270528  hitchhiker  0.000366483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0019  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0021  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0029  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0018  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>