41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0011 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0011  tRNA-Lys  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.106894 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  86.46 
 
 		 96 bp  91.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  97.22 
 
 		 97 bp  63.9  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  94.87 
 
 		 104 bp  61.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 98 bp  61.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  96.97 
 
 		 97 bp  58  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 78 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0005  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00128122  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 108 bp  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 109 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0031  tRNA-OTHER  93.94 
 
 		 97 bp  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000256784  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0025  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 122 bp  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0022  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 130 bp  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0018  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.29875 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0039  tRNA-OTHER  100 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0023  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0777816  normal  0.377314 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 		 117 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000377684  decreased coverage  0.000000420741 
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_1  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0038  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.266869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0039  tRNA-Thr  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0474661 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0012  tRNA-Asp  100 
 
 		 112 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.35465  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 113 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0044  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.335529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0019  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.964616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0028  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0618501  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0004  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0023  tRNA-OTHER  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0046836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>