17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_R0004 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 		 105 bp  208  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0018  tRNA-OTHER  90.74 
 
 		 107 bp  123  9e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.68509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0012  tRNA-OTHER  90.65 
 
 		 106 bp  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.794494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.805604 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0010  tRNA-OTHER  91.07 
 
 		 117 bp  71.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0464601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.759432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  60  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  60  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  60  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  56  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 		 96 bp  56  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0009  tRNA-OTHER  93.75 
 
 		 119 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0013  tRNA-OTHER  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.689744 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0025  tRNA-OTHER  89.47 
 
 		 128 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>