100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_R0023 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  95.59 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0006  tRNA-Lys  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303657  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0049  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.319616  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0005  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0046  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALysVIMSS1309293  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.180997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0047  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0672814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0055  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.756499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0025  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022777  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0024  tRNA-Lys  90 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0017  tRNA-Lys  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.674136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0018  tRNA-Lys  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.29875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALysVIMSS1309373  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.589902  normal  0.683475 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALysVIMSS1309193  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.238079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0025  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.810895  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0009  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0017  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.253247  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0045  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000031214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0010  tRNA-Lys  87.3 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAsnVIMSS1309105  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.512806  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0033  tRNA-Asn  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000143067  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0021  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0005  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0052  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0030  tRNA-Lys  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.49638 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0003  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.173284  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAsnVIMSS1309178  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAsnVIMSS1309287  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0057  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.590224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAsnVIMSS1309137  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.898434  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0032  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571749  normal  0.068685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0021  tRNA-Asn  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.552016 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0043  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0503955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0042  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0053  tRNA-Asn  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0032  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0036  tRNA-OTHER  91.89 
 
 		 108 bp  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4329  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0847408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 		 1563 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0004  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21987  normal  0.244967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0003  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.685555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0005  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.210303  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0052  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683016  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0043  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000129549  unclonable  0.000000000302545 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0025  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0024  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0024  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0042  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000326877  unclonable  0.000000000331306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0051  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000190999 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0053  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000900565 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0024  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0023  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0014  tRNA-Asn  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355539  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0038  tRNA-Met  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.719761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37540  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0863573  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0013  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114392  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0295  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0026  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000338371  normal  0.10818 
 
 
-
 
NC_002950  PGt34  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0014  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0079807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0037  tRNA-Lys  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0017  tRNA-Lys  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303738  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0030  tRNA-Lys  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.981752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0036  tRNA-Met  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0306  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0013  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00468588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0022  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134574 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1392  tRNA-Asn  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0031  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0843462 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0023  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000728017  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.259835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0024  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000367183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0025  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000379634  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLys02  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLys01  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05871  hypothetical protein  86.96 
 
 		 432 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.791766  normal  0.721442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>