11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0049 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.880915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0027  tRNA-Arg  95.59 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.658502  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0023  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.915707  normal  0.016906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0012  tRNA-Arg  95.59 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0021  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 72 bp  99.6  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.905442  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0019  tRNA-Arg  92.65 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.186619  normal  0.0165444 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0008  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0027  tRNA-OTHER  90.77 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000206606  hitchhiker  0.0000802829 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0012  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.683536  normal  0.458428 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0028  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00270528  hitchhiker  0.000366483 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0009  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 109 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.146506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>