12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0012 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.683536  normal  0.458428 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0008  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 72 bp  93.7  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0027  tRNA-OTHER  91.04 
 
 		 72 bp  85.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000206606  hitchhiker  0.0000802829 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0027  tRNA-Arg  90 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.658502  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0023  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.915707  normal  0.016906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0049  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.880915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0019  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.186619  normal  0.0165444 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0012  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0021  tRNA-Arg  86.76 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.905442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0025  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0045  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0008  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.605764  normal  0.032651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>