19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0043 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0043  tRNA-Met  100 
 
 
106 bp  210  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  97.06 
 
 
75 bp  60  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  92.68 
 
 
75 bp  58  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  92.68 
 
 
75 bp  58  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  92.68 
 
 
75 bp  58  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0029  tRNA-Met  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  94.12 
 
 
75 bp  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0037  tRNA-Val  96.55 
 
 
78 bp  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna28  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.751931  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0090  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  44.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.825054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0091  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  44.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.830426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0092  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  44.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.825054  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  94.12 
 
 
77 bp  44.1  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0008  tRNA-Met  90.48 
 
 
76 bp  44.1  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.192947 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0063  tRNA-Met  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0046  tRNA-Asp  100 
 
 
78 bp  44.1  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000106741  normal  0.144267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>