25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_R0007 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_R0007  tRNA-Met  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0007  tRNA-Met  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0007  tRNA-Met  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.860787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0006  tRNA-Met  97.26 
 
 
73 bp  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0204099  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0074  tRNA-Met  87.67 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565222  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0055  tRNA-Met  86.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  86.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  86.49 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0034  tRNA-Met  86.3 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.029342  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0049  tRNA-Met  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.404758  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  85.14 
 
 
77 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0076  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  84.93 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0065  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0045  tRNA-Met  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0052  tRNA-Gln  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000973809  hitchhiker  0.00167748 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R17  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  96.15 
 
 
78 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0959756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>