85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0052 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  96.83 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0046  tRNA-Met  96.15 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.413115  normal  0.314487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  92.06 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  91.67 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0043  tRNA-Met  90.48 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0063  tRNA-Met  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0038  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.944323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0014  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0011  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.312587  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0035  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0042  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0039  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0034  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0031  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  85.14 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0026  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0144424  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0023  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0236487  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_1  tRNA-Ile  90 
 
 		 95 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0055  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0020  tRNA-OTHER  88 
 
 		 122 bp  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.430944  hitchhiker  0.000000157514 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  85.51 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0041  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154494  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0029  tRNA-Ile  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 99 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  84.38 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 119 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0038  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000141075  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0041  tRNA-Met  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000311146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0047  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00104453  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0008  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0039  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000571794  hitchhiker  0.0000531069 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0013  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0007  tRNA-Met  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1260  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0074  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0016  tRNA-Met  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120577  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07660  tRNA-Met  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0045  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00121636  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0002  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0007  tRNA-Met  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.860787  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1239  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1317  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0566482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0002  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna53  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0079  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0007  tRNA-Met  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0046  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>