204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_R0039 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_R0014  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0011  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.312587  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0038  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.944323  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0035  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0023  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0236487  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0026  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0144424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0031  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0034  tRNA-Lys  100 
 
 
77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0039  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0042  tRNA-Lys  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0017  tRNA-Thr  93.75 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.545272  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0029  tRNA-Thr  93.75 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00440397  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0032  tRNA-Thr  93.75 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0028  tRNA-Thr  93.75 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0045  tRNA-Thr  93.75 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  93.48 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  86.96 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  90 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0073  tRNA-Lys  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  86.49 
 
 
75 bp  60  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0824  tRNA-Lys  89.8 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0733527  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0035    89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00887484  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2619  tRNA-Lys  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0471247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2626  tRNA-Lys  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2305  tRNA-Lys  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2312  tRNA-Lys  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0004  tRNA-Lys  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0005  tRNA-Lys  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0008  tRNA-Thr  86.67 
 
 
74 bp  56  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0245883  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0036  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0286926  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0035  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0289438  normal  0.257931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0027  tRNA-Lys  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0044  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243599  hitchhiker  0.00307567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0029  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4589  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0008  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0196539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0053  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4575  tRNA-Lys  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  89.13 
 
 
78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  89.13 
 
 
73 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  89.13 
 
 
78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5046  tRNA-Lys  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244729  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0017  tRNA-Lys  90.48 
 
 
75 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.674136 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0045  tRNA-Lys  90.24 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0427355  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0037  tRNA-His  87.76 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.28441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0084  tRNA-Lys  88.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00872406  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  90.24 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0019  tRNA-Lys  85.51 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0090  tRNA-Lys  92.5 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.28119  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112802  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0027  tRNA-Lys  88.64 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000236545  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  88.64 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0061  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0023  tRNA-His  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000017569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0023  tRNA-His  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0552  tRNA-Lys  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146239  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0839  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.343418  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>