More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0002 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0015  tRNA-Ile  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.173828  normal  0.314939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0002  tRNA-Ile  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0031  tRNA-Ile  93.59 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0042  tRNA-Ile  93.59 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  94.87 
 
 		 77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  93.59 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  93.59 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0013  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0012  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0037  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0038  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  93.59 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  93.59 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0012  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  93.59 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  93.59 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0038  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0013  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000076362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0008  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0037  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000489104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0044  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0477159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0052  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000626175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0042  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0171814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0029  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.303638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0007  tRNA-Ile  95.31 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00629205  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3111t  tRNA-Ile  95.16 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3075t  tRNA-Ile  95.16 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0013  tRNA-Ile  91.03 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0131677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  93.94 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  93.94 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  93.94 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0033  tRNA-Ile  89.87 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0222175  normal  0.680083 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0053  tRNA-Ile  89.87 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1085  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0259  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0058  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00171421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0017  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000136136  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0081  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4551  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.349279  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0063  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.809971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0033  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6551  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0039  tRNA-Ile  92.42 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0019  tRNA-Ile  92.42 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0010  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0369476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0040  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000178667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0026  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0532408 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0057  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.926394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0013  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.059772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0002  tRNA-Ile  92.42 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0008  tRNA-Ile  92.42 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0089  tRNA-Ile  92.42 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0099  tRNA-Ile  92.42 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6554  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0032  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000441039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0005  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0010  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121367  normal  0.0933113 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4579  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0007  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000593812  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0040  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0023  tRNA-Ile  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00128376  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0047  tRNA-Ile  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0053557  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0041  tRNA-Ile  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0110  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0002  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1568  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1603  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.840001 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1800  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.21567e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1806  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000532501 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0038  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>