More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0011 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0011  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.903466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00051  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00057  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3152  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469971  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0029  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.992262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3183  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3215  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3646  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4081  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0905537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0070  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0792206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0063  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0049  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0027  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.992262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4695  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0125  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166673  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4694  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0091  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136537  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3478  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0003  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00215026  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAMetVIMSS1309377  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00798098  hitchhiker  0.0000123944 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3661  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.677335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0070  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.628409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0069  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.043282  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0012  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0040  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0068  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0070  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0467546  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0023  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22048  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0028  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0034  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2957  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0117  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.214909  hitchhiker  0.0000036975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3467  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139541  normal  0.865403 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3136  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.364243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2956  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.211186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0069  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0763001  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4492  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3202  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.148125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4079  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4080  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3316  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.863126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0062  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3315  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3216  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3201  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.145985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3547  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.226089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0145  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000566193  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3584  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3153  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.311913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0023  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.216301  normal  0.182837 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3479  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.344656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAMetVIMSS1309167  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3135  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369915  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAMetVIMSS1309108  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAMetVIMSS1309196  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.868171  hitchhiker  0.00000970855 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAMetVIMSS1309263  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3185  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0068  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.516961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0087  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00788985  hitchhiker  0.000000411108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>