108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0039 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0017  tRNA-Asn  92.65 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0033  tRNA-Asn  92.65 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0053  tRNA-Asn  92.65 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0280094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0013  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00234115  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0042  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0057  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000258126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0084  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000101082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0007  tRNA-Asn  88.57 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0051  tRNA-Asn  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0051  tRNA-Asn  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0047  tRNA-Asn  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0008  tRNA-Asn  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0851483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0074  tRNA-Met  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t43  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.546364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0049  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000556498  normal  0.485056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09540  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0127203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0019  tRNA-Asn  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0021  tRNA-Asn  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0031  tRNA-Asn  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0017  tRNA-Asn  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0011  tRNA-Asn  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0075  tRNA-Asn  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0888868  normal  0.929022 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0025  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.691429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0031  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.61738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0034  tRNA-Met  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.029342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 155 bp  54  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0048  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0018  tRNA-Asn  86.79 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0030  tRNA-Asn  86.79 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.28172  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0043  tRNA-Asn  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00645597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t025  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0005  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404272  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0003  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.173284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.191014  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0086  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0041  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.335788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0070  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000571368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0086  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000450897  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0029  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.763657  normal  0.753454 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAsnVIMSS1309105  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.512806  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAsnVIMSS1309287  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0028  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000331563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0027  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000223271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0039  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000965131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0049  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000822334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0001  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.198088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t096  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000747728  normal  0.0921402 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>