179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0050 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_R0015  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0050  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.602947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.520938  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0059  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.938712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1734  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000527786  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1738  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000457664  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1156  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00893597  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1160  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0165656  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1589  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.153421  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2178  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2182  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2219  tRNA-Asp  94.44 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2259  tRNA-Asp  94.44 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0094  tRNA-Asp  94.34 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0093  tRNA-Asp  94.34 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0096  tRNA-Asp  94.34 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0005  tRNA-Asp  89.06 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0916  tRNA-Asp  90.91 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000370726  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0026  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0397308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0028  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0028  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0031  tRNA-Asp  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218034  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0030  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000948494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0031  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000010181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0027  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000032409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0028  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808447  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0027  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0245958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0029  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna40  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna39  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0028  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25090  tRNA-Asp  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.657176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0034  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.848663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0012  tRNA-Asp  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0030  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862295  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0514  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.30376  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0599  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0603  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.508716  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0511  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.304577  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0038  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0003  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3185t  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.643371  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2258  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0012215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2259  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00453346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2260  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00104987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2261  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000972867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2262  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0143888  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3181t  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162425  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0054  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000015644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0045  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115238  normal  0.0333455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0048  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000361323  normal  0.0154574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0063  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748951  normal  0.206184 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3115t  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0064  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0032  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.167731 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07691  tRNA-Asp  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170048  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0061  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0042  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000507757  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0026  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.472437 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3209t  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0030  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0018  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.130391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0056  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1400  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.754313 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna153  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.908141  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3140t  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0024  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000320512  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0025  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000839406  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0026  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000028925  normal  0.89976 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0027  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000271545  normal  0.890927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0028  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000281515  normal  0.867908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0024  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0027  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0019  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0571821  normal  0.107747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0021  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0325051  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0044  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0294288  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna036  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0051  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.942315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0069  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197557 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0029  tRNA-Asp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0063  tRNA-Asp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164235  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0024  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.603118 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1638  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.27117e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna047  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna061  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0067  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna092  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00954966  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna083  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0505  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00547208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0033  tRNA-Asp  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00294009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0068  tRNA-Asp  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000338378  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0024  tRNA-Asp  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000583743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0026  tRNA-Asp  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000484492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0062  tRNA-Asp  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.697015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>