More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0514 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0511  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.304577  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0514  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.30376  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0599  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0603  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.508716  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0018  tRNA-Asp  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0158  tRNA-Asp  97.01 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0054  tRNA-Asp  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000552526  normal  0.231331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0062  tRNA-Asp  95.52 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000866023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0028  tRNA-Asp  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00318123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0037  tRNA-Asp  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000102957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0054  tRNA-Asp  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566349  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0096  tRNA-Asp  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000496509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0054  tRNA-Asp  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338252  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0052  tRNA-Asp  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241383  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000370726  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0916  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 79 bp  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0005  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.128453  unclonable  0.0000112956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0046  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000017154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0079  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000855359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0125  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000018032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00209721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0139  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.595909  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0126  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0022  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000352228  hitchhiker  0.00000353756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0050  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0159  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00117614  hitchhiker  0.0000000316845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0047  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477067  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.602947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.520938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t001  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t054  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t102  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00373  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1156  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00893597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0008  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0007  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0128  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000146033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0127  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000164688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0153  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000144373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0177  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0012  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556518  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0026  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0039  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000226797  normal  0.246953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0137  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56493 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0114  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0080  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000081344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0012  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0041  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0047  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000429092  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0029  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0847414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0027  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00239727  normal  0.0594729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0004  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.660889  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03609  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00473  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0050  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0021  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000252162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1738  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000457664  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0067  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000256523  hitchhiker  0.000000993702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0126  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000166381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0066  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000109987  hitchhiker  0.00000103719 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03716  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0004  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.132491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0051  tRNA-Asp  95.24 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.942315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0041  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109501  normal  0.0527209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0018  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0114  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0124  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0082  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000108643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0027  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0041  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000325058  normal  0.507644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0027  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1734  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000527786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0016  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0392662 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0029  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0004  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.372238  hitchhiker  0.00144913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0019  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000445716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0103  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118993  normal  0.0723976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0104  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103964  normal  0.0748014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0004  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253522  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0103  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000505774  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0104  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000485826  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0138  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2178  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0082  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000638289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0083  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0130  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0049  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.256681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0052  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1160  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0165656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0018  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00246  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2182  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0004  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0119  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0078  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0004  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712007  hitchhiker  0.000000679169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0019  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0100  tRNA-Asp  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000567752  hitchhiker  0.00319693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>