More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1589 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1589  tRNA-Asp  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.153421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1156  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00893597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1734  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000527786  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2178  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.602947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.520938  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1738  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000457664  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2182  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1160  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0165656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0059  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.938712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2259  tRNA-Asp  94.83 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0050  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2219  tRNA-Asp  94.83 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0015  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0093  tRNA-Asp  94.44 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0094  tRNA-Asp  94.44 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0096  tRNA-Asp  94.44 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000370726  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0916  tRNA-Asp  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0028  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0028  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0027  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000032409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0028  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808447  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0026  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0397308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0027  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0245958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0029  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0028  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna39  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna40  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0038  tRNA-Asp  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000965548  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0039  tRNA-Asp  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000000917088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0040  tRNA-Asp  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000000989766  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0511  tRNA-Asp  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.304577  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0514  tRNA-Asp  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.30376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0030  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000948494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0031  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000010181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0599  tRNA-Asp  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0603  tRNA-Asp  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.508716  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0030  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862295  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0021  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0012  tRNA-Asp  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25090  tRNA-Asp  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.657176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0031  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218034  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0054  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000552526  normal  0.231331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0062  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000866023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0054  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566349  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0028  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00318123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0037  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000102957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0038  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0096  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000496509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0043  tRNA-Asp  90 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0054  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338252  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0052  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241383  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1400  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.754313 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0056  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0018  tRNA-Asp  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0054  tRNA-Asp  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000015644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0153  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000144373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0126  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t053  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t054  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t102  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0004  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0139  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.595909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0119  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0008  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0159  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00117614  hitchhiker  0.0000000316845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0026  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0039  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000226797  normal  0.246953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0067  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000256523  hitchhiker  0.000000993702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0066  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000109987  hitchhiker  0.00000103719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0050  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0029  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0847414 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03609  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0041  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109501  normal  0.0527209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0018  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0114  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0124  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0027  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0041  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000325058  normal  0.507644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0027  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0158  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0018  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0027  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00239727  normal  0.0594729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0004  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.660889  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0080  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000081344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0079  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000855359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0022  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000352228  hitchhiker  0.00000353756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0046  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000017154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0012  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0004  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712007  hitchhiker  0.000000679169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0019  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0100  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000567752  hitchhiker  0.00319693 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0101  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000609189  hitchhiker  0.00329166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0018  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00473987  normal  0.433792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0078  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>