29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0056 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0056  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000959605  hitchhiker  0.0000412261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  133  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0044  tRNA-Val  96.92 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0061  tRNA-Val  95.52 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.052362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0064  tRNA-Val  95.52 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051459  normal  0.742541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0062  tRNA-Val  95.38 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.268364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  95.24 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0010  tRNA-Val  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0233466  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0008  tRNA-Val  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0048  tRNA-Val  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00355278  normal  0.78382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0003  tRNA-Val  95 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.892516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0017  tRNA-Val  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.997912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0019  tRNA-Val  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0020  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0018  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0012  tRNA-Val  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.423329  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0047  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0043  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.455129  normal  0.0350776 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0006  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.330961  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0015  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0050  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>