26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0048 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0048  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00355278  normal  0.78382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0061  tRNA-Val  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.052362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0064  tRNA-Val  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051459  normal  0.742541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0062  tRNA-Val  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.268364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0044  tRNA-Val  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0056  tRNA-Val  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000959605  hitchhiker  0.0000412261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0017  tRNA-Val  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.997912  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0001  tRNA-Val  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0008  tRNA-Val  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0010  tRNA-Val  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0233466  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0007  tRNA-Val  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.997885  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0003  tRNA-Val  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.892516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0043  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.455129  normal  0.0350776 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0047  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0006  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0018  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0033  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0302721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>