15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0007 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0007  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.997885  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0001  tRNA-Val  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0048  tRNA-Val  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00355278  normal  0.78382 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0029  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0014  tRNA-Val  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190864  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0034  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0053  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.205376  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0034  tRNA-Val  90.7 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4575  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>