29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0062 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0062  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.268364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0044  tRNA-Val  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0061  tRNA-Val  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.052362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0064  tRNA-Val  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051459  normal  0.742541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0008  tRNA-Val  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0056  tRNA-Val  95.38 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000959605  hitchhiker  0.0000412261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0010  tRNA-Val  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0233466  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0048  tRNA-Val  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00355278  normal  0.78382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0017  tRNA-Val  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.997912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0003  tRNA-Val  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.892516 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0038  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132032  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0042  tRNA-Val  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461558 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0053  tRNA-Val  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.297714  normal  0.2473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0009  tRNA-Val  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0014  tRNA-Val  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190864  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0042  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00993442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0047  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0060  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00280005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0060  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000313438  normal  0.60416 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0034  tRNA-Val  88 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>